| 氏名 | 指導教官a | 研究題目 |
| 深田智史 | 石井信、湊小太郎、作村勇一、川端猛 | アクチンフィラメントによる糸状仮足伸長メカニズムのアクチン濃度依存性 |
| 岩西雄大 | 小笠原直毅、金谷重彦、土居洋文、土井晃一 | アミノ酸配列を用いた機械学習法の予測性能比較 |
| 野村智和 | 石井信、植村俊亮、柴田智広、作村勇一 | 単眼特徴時系列データからの頑健な物体構造復元のための因子分解アルゴリズムの比較 |
| 糸山宗秀 | 石井信、金谷重彦、黒川顕、川端猛 | 植物アレイの統合解析 |
| 小林悠一 | 石井信、植村俊亮、川人光男、銅谷賢治、柴田智広、作村勇一 | 小脳プルキンエ細胞の活動における登上線維入力の効果 |
| 鈴木郁美 | 石井信、金谷重彦、川端猛 | Microarray Gene Expression Analysis: A Selection Criterion for Robust Classifiers |
| 秋田 一 | 金谷重彦、小笠原直毅、 黒川顕、 川端猛 | 微生物ゲノムにおける塩基組成偏倚の体系化 |
| 田中宏幸 | 金谷重彦、 湊小太郎、 黒川顕、川端猛 | Polypurine/polypyrimidine配列の比較ゲノム解析 |
| 氏名 | 指導教官 | 研究題目 |
| 石部大介 | 植村俊亮、石井 信、川端 猛 | 予測構造とモチーフを利用したタンパク質配列間の弱い相同性の検索手法の開発 |
| 谷本心 | 石井 信、箱嶋敏雄、金谷重彦、川端 猛 | Analysis of Transmembrane Helices in Proteins: The Difficult-to-predict Helices |
| 福原直志 | 箱嶋敏雄、小笠原直毅、川端 猛 | 表面アミノ酸分布を用いたタンパク質間相互作用サイトの予測法の開発 |
| 氏名 | 指導教官 | 研究題目 |
| 植原克典 | 箱嶋敏雄、小笠原直毅、川端 猛 |
2次構造予測等を利用したタンパク質間の弱いアミノ酸配列相同性を検出する手法の開発 |
| 氏名 | 指導教官 | 研究題目 |
| 五十嵐康伸 | 石井 信、作村勇一 | 前頭前野の神経細胞が示す特異的発火活動におけるシナプス小胞サイクルの役割（仮題） |
| 氏名 | 指導教官 | 研究題目 |
| 行縄直人 | 石井 信、小笠原直毅、加藤菊也、川端 猛 | 統計的手法による遺伝子発現情報からの細胞状態の同定に関する研究 |
| 土居智和 | 石井 信、湊小太郎、川人光男、銅谷賢治、作村勇一 | 小脳長期抑圧のシグナル伝達経路の計算機シミュレーション |
| 村松孝彦 | 石井 信、金谷重彦、諏訪牧子、川端猛 | アミノ酸配列からの膜タンパク質の機能予測に関する研究 |
| 蓬莱尚幸 | 箱嶋敏雄、金谷重彦、 土井晃一、 土居洋文 | Studies on Prediciton of Protein Function Based on Oligopeptides |
| 氏名 | 指導教官 | 研究題目 |
| 目次正一 | 石井 信、箱嶋敏雄、郷 信広 | Two aspects of bioinformatics in different timescales: sampling problem on molecular dynamics simulation and perspective to the gliding mechanism of Mycoplasma mobile |