平成２０年度(2008)

• 機能ゲノム学・蛋白質情報学

  講義資料

  • [川端１]アミノ酸配列解析の展開

  • [川端２]蛋白質立体構造比較

  • [川端３]分子シミュレーション基礎

  レポート（締め切り：2009年2月12日(木)、提出先：情報事務室）

  • レポート課題のPDFファイル

  • レポート問題１の補足資料：MATRASサーバを利用した類似構造の発見方法

• 「バイオインフォマティクス」

  • 演習内容

    • [川端1] 配列相同性検索 演習

    • [川端2] マルチプルアライメントと分子系統樹 演習

    • [川端3] 立体構造の可視化と立体構造予測 演習

  • 班分け（2008/7/22）

    講義は定員３９名の演習室A207で行う演習授業であるため、受講人数を調整するための履修希望調査を事前に行います。 本講義の履修を希望する方は、必ず、７月４日（金）までに履修希望書を情報科学研究科事務室まで提出してください。提出にあたっては以下の授業日程表を参照し、３つの班（A,B,C）のうちどの班を希望するか記してください。調整後の最終的な班分けの結果は後日公示します。

    [履修希望書のPDFファイル]

  • ３班の構成

    三つの班(A,B,C)に分かれてそれぞれ8回の演習を行います。内容は同一です。

    　 　
    • A班: 情報の学生中心　　（シラバス記載の日程。情報の他の講義と重複しない。） 　　
    • B班: バイオの学生が中心
    • C班: バイオの学生が中心

  • ８回の演習の内容
    • [黒川I] 生物学の主要WEBデータベースの使用法I
    • [黒川II] 生物学の主要WEBデータベースの使用法II
    • [川端Ｉ] ペアワイズアライメントと配列相同性検索
    • [川端II] マルチプルアライメントと分子系統学基礎
    • [金谷I] マイクロアレイ解析 I 　　　　
    • [金谷II] マイクロアレイ解析 II
    • [川端III] 立体構造の可視化と立体構造予測
    • [作村I] システム生物学

  • 演習日程

    日付	１限	２限	３限	４限	５限
    7/21(月)	海の日
    7/22(火)		(ロボI)		A班[黒川1]	A班[黒川2]
    7/23(水)	B班[黒川1]	B班[黒川2]	C班[黒川1]	C班[黒川2]
    7/24(木)	B班[川端1]	B班[川端2]
    7/25(金)	(ロボI)	C班[川端1]	C班[川端2]	A班[川端1]	A班[川端2]
    7/28(月)
    7/29(火)	B班[金谷1]	B班[金谷2]		A班[金谷1]	A班[金谷2]
    7/30(水)	C班[金谷1]	C班[金谷2]
    7/31(木)	B班[川端3]	B班[作村1]
    8/1(金)	C班[川端3]	C班[作村1]		A班[川端3]	A班[作村1]

• 情報生命学I 講義予定

  日程	担当	演題	内容
  6/17(火)4限	湊	情報科学基礎I	情報科学の考え方と計算機の動作を簡単に説明する
  6/17(火)5限	湊	情報科学基礎II	コンピュータネットワークの仕組みを簡単に紹介する
  6/20(金)4限	黒川	配列決定技術と配列データベースI	バイオインフォマティクスの概観、分子生物学に関連するデータベースの紹介、塩基配列の決定技術の説明を行う
  6/20(金)5限	黒川	配列決定技術と配列データベースII	アッセンブル、遺伝子発見、アノテーション、微生物・動植物のゲノムの成り立ち、ESTおよびcDNAデータについて解説する
  6/24(火)4限	川端	ペアワイズアライメントと配列相同性検索	配列解析の基盤となるペアワイズアライメントの原理、および配列相同性解析について解説する
  6/24(火)5限	川端	マルチプルアライメントと分子系統学基礎	マルチプルアライメントの原理、モチーフおよびプロフィール法、さらに分子系統学の基礎を解説する
  6/27(金)4限	川端	生体高分子の立体構造とその予測	生体高分子の立体構造データの成り立ち、構造生物学の基礎、立体構造予測法を解説する
  6/27(金)5限	川端	試験

• 近畿大学農学部・生命情報学演習 6/3(火)の演習内容

• 近畿大学農学部・生命情報学演習 5/20(火)の演習内容

• 近畿大学農学部・生命情報学 6/3(火)の講義資料

• 近畿大学農学部・生命情報学 5/27(火)の講義資料

• 近畿大学農学部・生命情報学 5/20(火)の講義資料

• 近畿大学農学部・生命情報学 5/13(火)の講義資料

平成１９年度(2007)

平成１８年度(2006)