| ゼミナールI講演 |
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| 日時： | 平成24年11月21日(水)3限 (13:30 -- 15:00) |
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| 場所： | L1 |
| 講演者： | 上野 豊 (生体分子情報学(連携)・産業技術総合研究所) |
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| 題目： | スペクトラルクラスタリングによるタンパク質単粒子像の解析 |
| 概要： | この講義では、スペクトラルクラスタリングの手法を用いて、電子顕微鏡で捉えたタンパク質の単粒子画像を分類し、構造解析した例を紹介する。ランダムな向きである同一の分子画像を類似度行列に基づいて分類し、粒子が同じ向きである画像を加算平均してノイズを除去した構造情報を取得する。固有ベクトルを用いたその他のクラスタリング手法との違いを考える。そして、タンパク質の体積を３次元像再構成する手法についても解説する。計算機を駆使した研究を推進する産総研との連携講座である生体分子情報学講座のトピックスにも言及する。 |