生体画像知能研究室
生体画像ビッグデータをフル活用して未来の医療を創る
教員
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准教授:大竹 義人
otake@is.naist.jp | |
研究室のサイト | 準備中 |
研究を始めるのに必要な知識・能力
プログラミングと英語・数学の基礎知識は必要ですが、ヒトの体の構造・機能への好奇心、それを画像化したデータに含まれる情報を様々な視点から解析し、フル活用しようという行動力も大事です。
研究室の指導方針
まず、画像処理・人工知能のアルゴリズムの基礎理論と実装について学び、最新の論文を精読しながら、研究論文を書くための基本を学びます。その後、各自興味を持ったテーマについて教員と相談しながら研究課題を設定します。ほとんどの研究プロジェクトは、他大学・他機関の医師や医学研究者との共同研究のため、他分野の専門家に対して情報科学的視点から自分の研究を説明するコミュニケーション力を育成します。国内学会や国際会議での研究発表、学術論文誌への論文投稿を通じて、世界に通用する自立した研究者への成長をサポートします。
この研究で身につく能力
生体画像解析と人工知能に関連する先進的な技術と知識を習得できるだけでなく、実際の医療現場での課題に取り組むことで、問題解決能力も養われます。データ科学の手法を駆使して、新しい診断支援や治療後を予測するシステムの開発に関わることが可能です。また、プロジェクトベースの学習(PBL)を通じて、チームワークとリーダーシップのスキルも向上します。
修了生の活躍の場
修了生は、医療系、および、医療とは直接関係のない会社の両方に就職しています。研究の道を志す学生や起業を志す学生も全力で支援します。
研究内容
生体画像を解析し未来の医療に応用するための知能システムの研究を行っています.生体から計測した様々な種類の画像ビッグデータにより学習した人工知能を、診断・治療・予後予測に応用するとともに、医療現場からのニーズに動機づけられた人工知能の基礎技術開発を行います。
画像の理解を助ける知能
ビッグデータを深掘りする知能
体内の動きを予測する知能
研究設備
- 計算機:PCクラスタ(28CPU、168コア)、深層学習用GPUマシン(30台)、ファイルサーバ(HDD:230TB+SSD:159TB)
- ソフトウェア:3次元医用画像処理システム(Synapse Vincent、富士フイルム社製)、筋骨格モデリングソフト(Anybody、AnyBody Technology 社製)
- センサ類:3次元位置計測センサ(Northern Digital社製)、3次元形状スキャナ(Artec社製)、ワイヤレス筋電計(Delsys社製)、3次元超音波測定器(TELMED社製)
研究業績・共同研究・社会活動・外部資金など
- 研究業績:
(1) Masuda M, Soufi M, Otake Y, Uemura K, Kono S, Takashima K, Hamada H, Gu Y, Takao M, Okada S, Sugano N. Automatic hip osteoarthritis grading with uncertainty estimation from computed tomography using digitally-reconstructed radiographs. International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery. 2024 Mar 12:1-3.
(2) Li G, Otake Y, Soufi M, Taniguchi M, Yagi M, Ichihashi N, Uemura K, Takao M, Sugano N, Sato Y. Hybrid representation-enhanced sampling for Bayesian active learning in musculoskeletal segmentation of lower extremities. International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery. 2024 Jan 29:1-0.
(3) Gu Y, Otake Y, Uemura K, Soufi M, Takao M, Talbot H, Okada S, Sugano N, Sato Y. Bone mineral density estimation from a plain X-ray image by learning decomposition into projections of bone-segmented computed tomography. Medical Image Analysis. 2023 Dec 1;90:102970.
(4) Hiasa, Y, et al. Automated muscle segmentation from clinical CT using Bayesian U-net for personalized musculoskeletal modeling. IEEE Transactions on Medical Imaging. 2020;39(4):1030-1040.
(5) Soufi, M., et al. Liver shape analysis using partial least squares regression-based statistical shape model: application for understanding and staging of liver fibrosis. International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery 2019;14(12):2083-2093.
- 共同研究:大阪大学(整形外科、放射線科)、慶應義塾大学(放射線科)、愛媛大学(整形外科)、京都大学(人間健康科学)、鶴見大学(歯科)、米国・ジョンズホプキンス大学(医工学)、 米国・ハーバード大学(医工学)、韓国・Ajou大学(解剖学)などと共同研究。
- 外部資金:AMED(日本医療研究開発機構)、企業共同研究等、科研費等