植物アレイの統合解析
糸山 宗秀(0451011)
発表概要：生命現象を総合的にシステムとして理解するためには、細胞あるいは組織全体の遺伝子ネットワークを把握することが重要である。その基礎データを得る目的から種々の実験条件におけるマイクロアレイ解析が行われてきた。それらは主に２値の尺度、連続尺度、順序のない離散型尺度に限られた比較解析が中心であった。だが、これらの解析は一実験条件における遺伝子機能予測に限られた。しかし、生命現象下での各々の遺伝子ネットワークの多面性を理解するためには、全遺伝子群における多様な実験条件下での膨大な遺伝子発現情報を統合して解析しなければならない。そこで今回、多面的な機能を有する遺伝子ネットワークの解明を目的として、国内外のシロイナズナについて公開されているGeneChipデータ（約1000枚）をもとにこれらの発現量について特徴記述を検討した。
本研究でこのデータを用いて「発現量における再現性と遺伝子機能上の特徴」、「大半の実験条件で発現する機能未知遺伝子に対するオーソログ遺伝子による遺伝子機能推定」、「グラフクラスタリングと配列解析による機能未知遺伝子に対する機能推定」の三つに着目して研究を行った。