いろいろめも

データベース

 
formatdb -i uniprot_trembl.fasta -p T
で
pin file

database ver             n of proteins

swsprot 
              57              428650
              56.7           408099
              56              392667
       
nr          
              9-Jun-03    8924078
              8-Sep-12    7031513
       
trembl   
              40.1            7916844
              39.7            7001017

n of proteinsの値はgrep -cで
grep -c '>' uniprot_trembl.fasta

#################################
なぜか

uniprot_trembl.fasta　では　fastacmdでエラーがでる