参考資料 UniProt (swissprot)の5文字表記の生物種名の例

HUMAN Homo sapiens (Human) ヒト
GORGO Gorilla gorilla gorilla (Lowland gorilla) ゴリラ
PONPY Pongo pygmaeus (Orangutan) オラウータン
HYLLA Hylobates lar (Common gibbon) テナガザル
SAGFU Saguinus fuscicollis (Brown-headed tamarin) タマリン(小型のサル)
MACFA Macaca fascicularis (Crab eating macaque) カニクイザル
MACMU Macaca mulatta (Rhesus macaque) マカクサル
PANTR Pan troglodytes (Chimpanzee) チンパンジー
HORSE Equus caballus (Horse) ウマ
PIG   Sus scrofa (Pig) ブタ
BOVIN Bos taurus (Bovine) ウシ
GIRCA Giraffa camelopardalis (Giraffe) キリン
CANFA Canis familiaris (Dog) イヌ
VULVU Vulpes vulpes (Red fox) キツネ
URSAR Ursus arctos (Brown bear) (Grizzly bear) クマ
AILME Ailuropoda melanoleuca (Giant panda) パンダ
FELCA Felis silvestris catus (Cat) ネコ
PANTI Panthera tigris (Tiger) トラ
MUSIT Mustela itatsi (Japanese weasel) イタチ
LUTLU Lutra lutra (European river otter) カワウソ
HIPAM Hippopotamus amphibius (Hippopotamus) カバ
RHISO Rhinoceros sondaicus (Javan rhinoceros) サイ
HALGR Halichoerus grypus (Gray seal)  ハイイロアザラシ
MIRAN Mirounga angustirostris (Northern elephant seal) ゾウアザラシ
ZALCA Zalophus californianus (California sealion) アシカ
BALMU Balaenoptera musculus (Blue whale) クジラ
KOGSI Kogia simus (Dwarf sperm whale) クジラ
CEPEU Cephalorhynchus eutropia (Black dolphin) イルカ
ORCOR Orcinus orca (Killer whale) シャチ
RABIT Oryctolagus cuniculus (Rabbit) ウサギ
MOUSE Mus musculus (Mouse) ネズミ
TAMMI Tamias minimus (Least chipmunk) チビシマリス
CRIGR Cricetulus griseus (Chinese hamster) ハムスター
MESAU Mesocricetus auratus (Golden hamster) ハムスター
PIPAB Pipistrellus abramus (Japanese house bat) アブラコウモリ
MINFU Miniopterus fuliginosus (Japanese long-fingered bat) ユビナガコウモリ
ELEMA Elephas maximus (Indian elephant) インドゾウ
DUGDU Dugong dugon (Dugong) ジュゴン
MACGI Macropus giganteus (Eastern gray kangaroo) カンガルー
SARHA Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil) フクログマ
PHACI Phascolarctos cinerues (Koala) コアラ

LACVV Lacerta vivipara (Common lizard)  トカゲ
PODMU Podarcis mularis (Wall lizard) イワカナヘビ(トカゲの一種)
LACBL Lacerta bilineata (Western green lizard) (トカゲの一種)
IGUIG Iguana iguana (Common iguana) イグアナ
TERCA Terrapene carolina (Eastern box turtle) ハコガメ
CHEMY Chelonia mydas (Green sea-turtle) アオウミガメ
APAFE Apalone ferox (Florida softshell turtle) スッポン
ALLMI Alligator mississippiensis (Mississippi alligator) ミシシッピーワニ
ALLSI Alligator sinensis (Chinese alligator) ヨウスコウワニ
CRONI Crocodylus niloticus (Nile crocodile) ナイルワニ 
CAICR Caiman crocodilus (Spectacled caiman)  カイマンワニ
AGKBL Agkistrodon blomhoffii siniticus (Chinese mamushi) マムシ
BOACO Boa constrictor (Boa) ボア(ヘビの一種)
PYTSE Python sebae (African rock python) パイソン(ヘビの一種)
OPHHA Ophiophagus hannah (King cobra) キングコブラ(ヘビの一種)


CHICK Gallus gallus (Chicken) ニワトリ
CORBR Corvus brachyrhynchos (American crow) カラス
VIRLA Vireo latimeri (Puerto rican vireo) モズモドキ
AQUCH Aquila chrysaetos chrysaetos (Golden eagle) ワシ
APTPA Aptenodytes patagonicus (King penguin) キングペンギン
EUDCH Eudyptes chrysocome (Rockhopper penguin) イワトビペンギン

XENLA Xenopus laevis (African clawed frog) アフリカツメガエル
RANNI Rana nigromaculata (Japanese pond frog) ウシガエル
RANSI Ranodon sibiricus (Siberian salamander) サンショウウオ


SALSA Salmo salar (Atlantic salmon) サケ
SCOSC Scomber scombrus (Atlantic mackerel) サバ
CARAU Carassius auratus (Goldfish) キンギョ
DANRE Danio rerio (Zebrafish) ゼブラフィッシュ
CYPCA Cyprinus carpio (Common carp) コイ
ANGRO Anguilla rostrataSalmo (American eel) ウナギ
LEPSP Lepisosteus spatula (Alligator gar) (Atractosteus spatula)ガー
PRIGL Prionace glauca (Blue shark) サメ
PASSE Pastinachus sephen(Cowtail stingray) エイ


DROME Drosophila melanogaster (Fruit fly) ショウジョウバエ
ANOQU Anopheles quadrimaculatus (Mosquito) カ
LOCMI Locusta migratoria (Migratory locust) トノサマバッタ
RETFL Reticulitermes flavipes(Eastern subterranean termite) シロアリ
SAMCR Samia cynthia ricini (Indian eri silkmoth) カイコガ
BLAGE Blattella germanica (German cockroach) チャバネゴキブリ

TACTR Tachypleus tridentatus (Japanese horseshoe crab) カブトガニ
MACLE Macrobrachium lanchesteri (Prawn) テナガエビ
CHEDE Cherax destructor (Yabbie) ザリガニ
PENJP Penaeus japonicus (Kuruma prawn) クルマエビ
CALSI Callinectes sapidus (Blue crab) アオガニ
ARTSF Artemia sanfranciscana (Brine shrimp) ホウネンエビ
DAPPU Daphnia pulex (Water flea) ミジンコ
PRICU Priapulus caudatus (Priapulid worm) エラヒキムシ(鰓曳き虫)
CAEEL Caenorhabditis elegans (namatode) 線虫 #UniprotのCYB_CAEELの配列には疑問?

AURAU Aurelia aurita (Moon jellyfish) ミズクラゲ

LUMTE Lumbricus terrestris (Common earthworm) ミミズ

CIOIN Ciona intestinalis (Transparent sea squirt) ホヤ

PLAFA Plasmodium falciparum マラリア原虫

ORYSI Oryza sativa subsp. indica   (Rice) コメ(インディカ)
ORYSJ Oryza sativa subsp. japonica (Rice) コメ(ジャポニカ)
WHEAT Triticum aestivum (Wheat) コムギ
SOLTU Solanum tuberosum (Potato) ジャガイモ
MAIZE Zea mays (Maize) モロコシ
PEA  Pisum sativum (Garden pea) マメ
ARATH Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) シロイヌナズナ
DAUCA Daucus carota (Carrot) ニンジン
VITVI Vitis vinifera (Grape) ブドウ
TOBAC Nicotiana tabacum (Common tobacco) タバコ
MARPO Marchantia polymorpha (Liverwort) ゼニゴケ
CHOCR Chondrus crispus (Carragheen) トチャカ (紅藻の一種)
SACJA Saccharina japonica (Sweet kelp) マコンブ

CHLRE Chlamydomonas reinhardtii コナミドリムシ(クラミドモナス;光合成単細胞鞭毛虫)


DICDI Dictyostelium discoideum (Slime mold) キイロタマホコリカビ(粘菌)

YEAST Saccharomyces cerevisiae (Baker's yeast) 出芽酵母
CANGA Candida glabrata カンジダ
SCHPO Schizosaccharomyces pombe (Fission yeast) 分裂酵母

ASPOR Aspergillus oryzae ニホンコウジカビ

ECOLI Escherichia coli         大腸菌
ECO57 Escherichia coli O157:H7 大腸菌O157
HAEIN Haemophilus influenzae インフルエンザ菌
SALTY Salmonella typhimurium   サルモネラ菌
SALTI Salmonella typhi         サルモネラ菌
VIBCH Vibrio cholerae          コレラ菌
HELPY Helicobacter pylori      ピロリ菌
LACDA Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus (strain ATCC 11842 / DSM 20081) 乳酸菌
PSEP1 Pseudomonas putida (strain F1 / ATCC 700007) 緑膿菌
PSEAE Pseudomonas aeruginosa 緑膿菌
SHIDS Shigella dysenteriae serotype 1 (strain Sd197) A群赤痢菌・志賀赤痢菌
BACSU Bacillus subtilis        枯草菌
CHLTR Chlamydia trachomatis クラミジア菌
STAA8 Staphylococcus aureus (strain NCTC 8325) 黄色ブドウ球菌
STRPN Streptococcus pneumoniae 肺炎球菌
SYNP2 Synechococcus sp. (strain ATCC 27264 / PCC 7002 / PR-6) シアノ細菌
MYCTU Mycobacterium tuberculosis 結核菌
MYCGE Mycoplasma genitalium マイコプラズマ菌
ERWCT Erwinia carotovora       軟腐病菌
HAES1 Haemophilus somnus (strain 129Pt)  ヘモフィラス菌

METJA Methanocaldococcus jannaschii メタン菌
SULSO Sulfolobus solfataricus スルフォロブス好熱菌
METKA Methanopyrus kandleri 超好熱メタン菌