| 日時(Date) | 平成30年6月19日（火）4限（15:10--16:40) Tue. June 19th, 2018, 4th Period (15:10--16:40) |
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| 場所(Location) | L1 |
| 司会(Chair) | Mazen Soufi 助教 (Assist. Prof. Mazen Soufi) |
| 講演者(Presenter) | 上野 豊 (産業技術総合研究所 バイオメディカル研究部門 主任研究員) |
| 題目(Title) | 電子顕微鏡単粒子画像のスペクトラルクラスタリング |
| 概要(Abstract) | スペクトラルクラスタリングの手法を用いて、電子顕微鏡で捉えたタンパク質の単粒子画像を分類し、構造解析する手法を紹介する。特にクラスタリングにおける教師無し学習について考えたい。ランダムな向きである同一の分子画像を類似度行列に基づいて分類し、粒子が同じ向きである画像を加算平均してノイズを除去した２次元像を取得する。そして、タンパク質の体積が３次元像再構成される。バイオインフォマティックスを推進する産総研との連携研究室である生体分子情報学研究室のトピックスも紹介する。 |
| 講演言語(Language) | 日本語 |
| 講演者紹介(Introduction of Lecturer) | 連携大学院となる生体分子情報学研究室として学生を受け入れています。1987年大阪大学修士課程修了後、帝人株式会社ソフトウェア技術職を経て、大阪大学基礎工学研究科生物工学分野博士過程を修了し、 1996年通産省・電子技術総合研究所主任研究員。組織変更により産業技術総合研究所生命情報工学研究センター、バイオメディカル研究部門に所属。 2002年より奈良先端科学技術大学院大学客員職を併任。 |