＞＞論文業績　＜＜ Hozumi A, Satouh Y, Ishibe D, Kaizu M, Konno A, Ushimaru Y, Toda T, Inaba K. Local database and the search program for proteomic analysis of sperm proteins in the ascidian Ciona intestinalis. Biochem Biophys Res Commun. 2004 Jul 9;319(4):1241-6. ＞＞査読付き学会発表＜＜ Honda Naoki, Yuichi Sakumura and Shin Ishii, Local signaling with molecular diffusion as a decoder of Ca2+ signals in synaptic plasticity. Molecular Systems Biology (EMBO and Nature Publishing Group), 2005. Kinya Okada, Shigehiko Kanaya, and Kiyoshi Asai "Accurate extraction of functional associations between proteins based on common interaction partners and common domains" Bioinformatics, 22, 2043-2048, 2005 ＞＞査読無し学会発表＜＜ 石部大介、植原克典、郷信広、川端猛. 「予測構造とモチーフを利用したタンパク質配列間の弱い相同性の検出」第６回ワークショップ 微生物ゲノム研究のフロンティア2004年3月5〜6日　かずさアカデミアホール　ポスター発表 Daisuke Ishibe, Katsunori Uehara, Takeshi Kawabata, Nobuhiro Go ”Detection of remote homologue using predicted structural information”. The 14th International Conference on Genome Informatics (GIW2003), 2003年12月14日−17日 Pacifico Yokohama, ポスター発表 福原直志、川端 猛、郷信広 「表面アミノ酸分布に基づくタンパク質間相互作用サイトの予測」 日本生物物理学会第41回年会, 2003年9月23日〜25日、新潟コンベンションセンター　ポスター発表 Fukuhara,N., Kawabata,T., Go,N. “Prediction of Protein-Protein Interaction Sites using Residue Interface Propensity” 国際シンポジウム “Frontiers in Bioinformatics: Structure, Interaction and Function”. 2004年2月10日 京都市国際交流会館　ポスター発表 福原直志、川端 猛、郷信広 「表面アミノ酸分布に基づくタンパク質間相互作用サイトの予測」 特定領域研究「統合ゲノム」第6回ワークショップ, 2004年3月5日〜6日、かずさアカデミアホール　ポスター発表 Fukuhara,N., Kawabata,T., Go,N. “Prediction of Protein-Protein Interaction Sites using Residue Interface Propensity” Pacific-Rim International Conference on Protein Science (PRICPS) 2004. 2004年4月14日−18日 パシフィコ横浜　ポスター発表 Fukuhara,N., Kawabata,T., Go,N. “Prediction of Protein-Protein Interaction Sites using Residue Interface Propensity” UMN / NAIST Joint workshop “Systems Analysis of Biological Processes”. 2004年7月22日−23日 ミネソタ大学 (Minneapolis, Minnesota, 米国)　ポスター発表 Fukuhara,N., Kawabata,T., Go,N. “Selection of Proper Template Complex for Modeling Protein-Protein Complex” International Conference on Genome Informatics (GIW) 2004. 2004年12月13日−15日 パシフィコ横浜　ポスター発表 Fukuhara,N., Kawabata,T., Go,N. “Accuracy of Protein-Protein Interface Prediction using Homology Modeling” Pacific Symposium on Biocomputing (PSB) 2005. 2005年1月4日−8日 The Fairmont Orchid (Kohala Coast, Hawaii, 米国)　ポスター発表 福原直志、川端 猛、郷信広 「統計ポテンシャルを用いたタンパク質間相互作用予測」日本蛋白質科学会第5回年会, 2005年6月30日〜7月2日、福岡国際会議場　ポスター発表 福原直志、川端 猛、郷信広 「統計ポテンシャルを用いたタンパク質間相互作用予測」日本生物物理学会第43回年会, 2005年11月23日〜25日、札幌コンベンションセンター　ポスター発表 及川雅隆、米谷佳晃、郷信広 「熱力学積分法を用いたペルオキシダーゼとリガンドの相互作用の自由エネルギー計算」 第19回分子シミュレーション討論会, 2005年11月29日〜12月1日、自然科学研究機構 岡崎コンファレンスセンター, ポスター発表 Honda Naoki, Yuichi Sakumura and Shin Ishii, Local signaling with diffusion process as a decoder of Ca2+ signals in synaptic plasticity. EMBO workshop -The Assembly and Function of Neuronal Circuits- (poster presentation), Ascona, Switzerland, September 2005. 本田 直樹, 作村 諭一, 石井 信, シナプス可塑性における拡散に基づいたカルシウムシグナル局所分子制御, 日本神経回路学会 第15回全国大会（ポスター発表）, 鹿児島大学 稲盛会館, 2005年 9月 Honda Naoki, Yuichi Sakumura and Shin Ishii, Spatial Issues on Ca2+ Signaling: Local Signaling with Molecular Diffusion in Synaptic Plasticity. International Student Symposium on Molecular Cell Biology (oral presentation), Nara Institute of Science and Technology, Nara, Japan, December 2005. Takaaki Matsui, Naoki Honda, Yuichi Sakumura and Yasumasa Bessho, Analysis of the molecular mechanisms for the somite segmentation clock. NAIST-CDB International Symposium -Frontiers in Developmental Biology- (poster presentation), Nara-Ken New Public Hall, Nara, Japan, December 2005. 本田 直樹, 作村 諭一, 石井 信, シナプス可塑性を制御する局所Ca2+シグナルにおける拡散効果の役割 NAIST バイオCOEサマーキャンプ（口頭およびポスター発表） 兵庫県立　淡路夢舞台国際会議場, 2005年 9月 Honda Naoki, Yuichi Sakumura, & Shin Ishii, Spatial Effects on Ca2+ Signaling in Neurons: A Simulation Study. System Analysis of Biological Processes (poster presentation). University of Minnesota, Minneapolis, Minnesota, USA, July 2004. Kinya Okada and Kiyoshi Asai “Prediction of uncharacterized protein functions by integrating protein-protein interaction data and domain information,” GIW2004, poster Kinya Okada, Md. Altaf-Ul-Amin, Hirotada Mori, Shigehiko Kanaya, and Kiyoshi Asai “Characterizing protein function by integrating interaction data and domain information,” RECOMB 2004, poster Kinya Okada and Kiyoshi Asai "ドメイン情報を用いたタンパク質間相互作用データの解析" 第4回 産総研 生命情報科学人材養成コース シンポジウム 2004, poster Kinya Okada, Hiroyuki Oka, Masanori Arita, and Kiyoshi Asai ”Protein-protein interaction similarities based on Gene Ontology,” Minnesota Bioinformatics Workshop 2004, poster 森村哲郎, 松山和裕, 林卓治, 鮫島和行, 銅谷賢治．「人の行動データの系列モンテカルロ法解析による意思決定モデルの検証」　脳と心のメカニズム　第5回夏のワークショップ「意志決定：心の物質基盤」2004年8月24日〜26日　NASPAニュ−オ−タニ　ポスター発表 森村哲郎、内部英治、銅谷賢治．「割引報酬のもとでの強化学習におけるTD誤差を利用した自然方策勾配法」　2005年3月28〜30日　玉川大学工学部校舎　口頭発表 林卓治，鮫島和行，銅谷賢治．「強化学習における最適な割引率とは？」脳と心のメカニズム 第5回夏のワークショップ　ポスター発表 須原 優一, 柴田 智広, 大賀 辰秀, 植木 美乃, 美馬 達哉, 石井 信. (2004). 自己回帰モデルを用いた脳波・筋電信号の相互作用解析と臨床応用. 第43回日本エム・イー学会予稿集, p.726. 秋冨穣、小林和夫、小笠原直毅、Md.Altaf-Ul-Amin、黒川顕、金谷重彦 「枯草菌マイクロアレイデータからのプロモーター予測」第7回微生物ゲノム研究のフロンティア、2005年3月5日〜6日 かずさアカデミアホール　ポスター発表 Akitomi J., Kurokawa K., Kanaya S., “Prediction of transcription units and sigma-regulation of gene on Bacillus subtilis genome.” グラム陽性菌のゲノム生物学研究会(2004)、焼津グランドホテル　ポスター発表 深田智史,作村諭一,加藤薫,石井信. (2005).「アクチンフィラメント伸張応答のアクチン濃度依存性」日本神経回路学会第15回全国大会(JNNS2005), pp.54-55.ポスター発表 岩西雄大、三森智裕、蓬莱尚幸、土井晃一、土居洋文「Conditional Random Fields法を用いたシグナルペプチドの開裂部分の予測」IPSJ SIGBIO 4. 2006年2月10日, 北海道大学　口頭発表. Itoyama, M., Kobayasi, H., Amin, MA., Kurokawa, K., Kanaya , S., “Gene Classification for Arabidopsis thaliana based on expression profiles utilized by 1000 GeneChip” The Asia-Pacific Bioinformatics Conference:APBC2006,2006年1月3日−7日 Taipei in Taiwan　ポスター発表 Ikumi S., Shigeyuki O., Shin I. "A Selection Criterion for Robust Classifiers: Camcer Prognosis with Microarray Gene Expression". 2005年12月19日-21日 The 16th International Conference on Genome Informatics (GIW). ポスター発表 鈴木郁美, 大羽成征, 平山淳一郎, 石井　信 「テスト性能の分散を考慮したロバストな判別器の選択基準」 電子情報通信学会　非線形問題研究会 (NLP)/ニューロコンピューティング研究会(NC), 2005年11月18日-19日, 九州工業大学, 口頭発表 秋田 一、真保 陽子、中村 由紀子、小川 倫洋、Md.Altaf-Ul-Amin、黒川 顕、金谷 重彦 「微生物ゲノムにおける塩基組成偏倚の体系化」 文部省科学研究費補助金・特定領域研究・統合ゲノム主催・第6回ワークショップ・微生物ゲノム研究のフロンティア, 2005年3月5〜6日, ポスター発表 秋田 一、真保 陽子、中村 由紀子、小川 倫洋、Md.Altaf-Ul-Amin、黒川 顕、金谷 重彦 「微生物ゲノムにおける塩基組成偏倚の体系化」 第28回日本分子生物学会年会, 2005年12月7〜10日, ポスター発表 田中宏幸、Md. Altaf-Ul-Amin、黒川 顕、金谷 重彦 「Polypurine/polypyrimidine配列の比較ゲノム解析」 DNA構造を基盤とするゲノム生理学の展開,2004年11月4日~5日、岡崎生理学研究所 田中宏幸、Md. Altaf-Ul-Amin、黒川 顕、金谷 重彦 「Polypurine/polypyrimidine配列の比較ゲノム解析」 DNA構造を基盤とするゲノム生理学の展開, 2005年11月17日~18日、岡崎コンファレンスセンター 田中宏幸、Md. Altaf-Ul-Amin、黒川 顕、金谷 重彦 「Polypurine/polypyrimidine配列の比較ゲノム解析」 日本分子生物学会第28回年会, 2005年12月7日~10日、福岡 ヤフードーム ポスター発表