＞＞論文業績　＜＜

Kita-Matsuo H, Yukinawa N, Matoba R, Saito S, Oba S, Ishii S and Kato K: Adaptor-tagged competitive polymerase chain reaction: amplification bias and quantified gene expression levels. Anal Biochem. 2005, Apr 1; 339:15-28 (2005).

行縄 直人, 吉本 潤一郎, 大羽 成征, 石井 信: 線形ダイナミカルシステムモデルの変分ベイズ推定による 遺伝子発現時系列のシステム同定, 情報処理学会論文誌: 数理モデル化と応用, 46(10), 57-65, (2005).

Yukinawa N, Oba S, Kato K, Taniguchi K, Iwao-Koizumi K, Tamaki Y, Noguchi S and Ishii S: A multi-class predictor based on a probabilistic model: application to gene expression profiling-based diagnosis of thyroid tumors. BMC Genomics (in revision).

Inositol 1,4,5-trisphosphate-dependent Ca2+ threshold dynamics detect spike timing in cerebellar Purkinje cells.
Tomokazu Doi, Shinya Kuroda, Takayuki Michikawa, Mitsuo Kawato
The Journal of Neuroscience 25(4): 950-961, 2005


Yabuki,Y., Muramatsu,T., Hirokawa,T., Mukai,H., Suwa,M. “GRIFFIN: a system for predicting GPCR-G-protein coupling selectivity using a support vector machine and a hidden Markov model”. Nucleic Acids Res. 33, W148-53.(2005) 

Hisayuki Horai, Kouichi Doi, and Hirofumi Doi,  Automatic Prediction of Enzyme Activity Based on Oligopeptides, Journal of Computer Aided Chemistry, 6:83-89, 2005.


＞＞査読付き学会発表＜＜

Yukinawa N, Yoshimoto J, Oba S, Ishii S: Modeling gene expression dynamics based on a linear dynamical system model. International Symposium on Nonlinear Theory and its Applications (NOLTA) 2004, 577-580 (2004). 2004年11月29日〜12月3日、アクロス福岡 口頭発表

中川 隆公, 大平 美紀, 行縄 直人, 大羽 成征, 鈴木 郁美, 石井 信, 花本 尊之, 神山 俊哉, 中西 一彰, 高橋 将人, 富岡 伸元, 伊藤 智雄, 蒲池 浩文, 植村 一仁, 平田 隆洋, 久保 浩之, 松下 通明, 中川原 章, 藤堂 省: cDNA microarrayを用いた肝細胞癌の遺伝子解析: 予後予測を含めた臨床応用への試み. 日本外科学会雑誌第106巻臨時増刊号2005年 第105回日本外科学会定期学術集会抄録集, pp. 125, (2005). 2005年5月11日〜13日 名古屋国際会議場 口頭発表

Yukinawa N, Oba S, Kato K, and Ishii S: Multi-class pattern classification based on a probabilistic model of combining binary classifiers. International Conference on Artificial Neural Networks (ICANN 2005), Lecture Notes in Computer Science 3697, 337-342 (2005). 2005年9月11日〜15日 Gromada Hotel (Warsaw, ポーランド) 口頭発表


Hisayuki Horai, Kouichi Doi, and Hirofumi Doi, Viewing the Proteome from Oligopeptides and Prediction of Protein Function, Genome Informatics, 16(2): 174-182, oral presentation in GIW 2005, Pacifico Yokohama, 2005 December 20.


＞＞査読なし学会発表＜＜
行縄 直人, 吉本 潤一郎, 大羽 成征, 石井 信: 線形ダイナミカルシステムモデルによる細胞周期制御のシステム同定. 日本神経回路学会第13回全国大会, pp.138-139, (2003). 2003年9月8日〜10日 法政大学 富士見校舎 ポスター発表

北-松尾 浩子, 行縄 直人, 大羽 成征, 石井 信, 加藤 菊也: アダプター付加競合PCRによる遺伝子発現絶対量定量法. 第26回日本分子生物学会年会 (2003). 2003年12月10日〜13日 神戸国際展示場 ポスター発表

Yukinawa N, Yoshimoto J, Oba S, and Ishii S: System identification of cell-cycle-regulated genes based on a linear dynamical system model, Pacific Symposium on Biocomputing (PSB) 2004, (2003). 2004年1月6日〜10日 Fairmont Orchid (Big Island, Hawaii, 米国) ポスター発表

Naoto Yukinawa: System Identification of Cell-cycle-regulated genes based on linear dynamical system model. 第２回 NAIST Bio-COE国際シンポジウム, 2004年1月19日〜20日 奈良先端科学技術大学院大学 ポスター発表

行縄 直人, 吉本 潤一郎, 大羽 成征, 石井 信: 線形ダイナミカルシステムモデルの変分ベイズ推定による遺伝子発現時系列のシステム同定. 情報処理学会研究報告, 数理モデル化と問題解決研究会 No.51, 2004-MPS-51(4), pp. 13-16, (2004). 2004年9月13日 口頭発表

Oba S, Yukinawa N, Kato K, and Ishii S: Multi-class pattern classification based on a probabilistic model combining binary classifiers. International symposium on the art of statistical metaware at ISM 2005, (2005). 2005年3月14日〜16日 統計数理研究所 ポスター発表

行縄 直人, 大羽 成征, 加藤 菊也, 石井 信: 二値分類器組み合わせの確率モデルによる多クラスパターン識別. 電子情報通信学会技術研究報告 NC2004-224, Vol.104, No.760, pp.183-187 (2005). 2005年3月28日〜30日 玉川大学 口頭発表

行縄 直人, 大羽 成征, 加藤 菊也, 石井 信: 二値分類器集合による遺伝子発現プロファイルからの癌サブクラス識別法. 情報処理学会バイオ情報学研究会 No. 1, 2005-BIO-1, pp. 9-15 (2005). 2005年7月25日 産業技術総合研究所 臨海副都心センター 口頭発表

谷口 一也, 小泉 恭子, 行縄 直人, 大羽 成征, 野口 眞三郎, 石井 信，加藤 菊也: 二値分類器集合による多値分類器の構築: 遺伝子発現プロファイルの甲状腺組織診断への応用. 第28回日本分子生物学会年会, (2005). 2005年12月7日〜10日 ヤフードーム ポスター発表

Yukinawa N, Oba S, Kato K, and Shin Ishii: Optimal Aggregation of Binary Classifiers: A Novel Multi-class Predictor for Gene Expression Profiling-based Diagnosis of Tumors. 第4回 NAIST Bio-COE 国際シンポジウム, (2005). 2005年12月15日〜16日 奈良先端科学技術大学院大学 ポスター発表

Spike-timing detection by calcium signaling pathways of cerebellar Purkinje cells in different forms of long-term depression.
Tomokazu Doi, Shinya Kuroda, Takayuki Michikawa, Mitsuo Kawato
Society for Neuroscience 33rd Annual Meeting, New Orleans, November 2003、口頭発表

Spontaneous activity of parallel fibers autoregulates the amount of AMPA receptors to elicit cerebellar LTD for supervised learning.
Tomokazu Doi, Shinya Kuroda, Takayuki Michikawa, Kenji Doya, Mitsuo Kawato
Society for Neuroscience 35th Annual Meeting, Washington DC, November 2005、ポスター発表

小脳プルキンエ細胞への入力タイミングを検出するCa2+濃度に変換するシグナル伝達のシミュレーション
土居智和・黒田真也・道川貴章・川人光男
電気情報通信学会ニューロコンピューティング研究会、琉球大学、2002年6月、口頭発表

シナプス入力タイミングを検出するシグナル伝達のシステム解析
土居智和・黒田真也・道川貴章・川人光男
日本神経回路学会第12回全国大会、鳥取大学、2002年9月、口頭発表+ポスター発表

IP3-dependent Ca2+ threshold dynamics detect spike-timing for synaptic plasticity in cerebellar Purkinje cells
土居智和・黒田真也・道川貴章・川人光男
第76回日本生化学会大会、パシフィコ横浜、2004年10月、口頭発表+ポスター発表

小脳長期抑圧の入力選択性が自発発火頻度依存で調節される
土居智和・黒田真也・道川貴章・銅谷賢治・川人光男
日本神経回路学会第15回全国大会、鹿児島大学、2005年9月、口頭発表+ポスター発表


村松孝彦、諏訪牧子.「 Gタンパク質結合選択性に相関性のあるGPCRの配列及び構造的特徴」日本生物物理学会第40回年会, 2003年11月2日〜4日、名古屋大学 口頭発表

村松孝彦、諏訪牧子. 「位置特異的配列プロファイルを利用したGPCRのGタンパク質に対する共役特異性に関する解析」. 日本生物物理学会第41回年会, 2003年9月23日〜25日、新潟コンベンションセンター　ポスター発表

Muramatsu,T., Suwa,M. “Bioinformatics Analysis for the Receptor-G-protein coupling Selectivity”. Frontiers in Bioinformatics: Structure, Interaction and Function. 2004年2月10日 京都市国際交流会館 ポスター発表

Suwa,M., Yabuki,Y., Muramatsu,T., Hirokawa,T., Mukai,H. “GPCR and G-protein Coupling Selectivity Prediction Based on SVM with Physico-Chemical Parameters”. 2004. International Conference on Genome Informatics (GIW) 2004. 2004年12月13日−15日 パシフィコ横浜 ポスター発表

Muramatsu,T., Suwa,M. “Sequence Alignment Tool of Membrane Protein” 2004. International Conference on Genome Informatics (GIW) 2004. 2004年12月13日−15日 パシフィコ横浜 ポスター発表